تحديد متغيرات غامضة للجين المرتبط بسرطان القولون
تنتقل الجينات من الوالدين، مما يحدد السمات مثل لون العين والطول وكذلك خطر الإصابة بأمراض معينة.
وعلى الرغم من أن الجينات المرتبطة بالسرطان مثل BRCA1 وTP53 مألوفة نسبيًا، فإن معظم المتغيرات تندرج ضمن فئة شاملة تُعرف باسم المتغيرات ذات الأهمية غير المؤكدة.
في الوقت الحالي، فإن الشخص الذي لديه تاريخ عائلي لديه فرصة محدودة لاستخدام بيانات الفحص الجيني الخاصة به لتحديد مخاطر الإصابة بمعظم الأمراض.
كشفت دراسة حديثة أجراها مختبر جاكوب كيتزمان، بكلية الطب بجامعة ميشيغان، عن المزيد من الأدلة حول الخطر الذي تُسببه متغيرات في جين مرتبط بسرطان القولون، يُسمى MUTYH، والذي تتمثل وظيفته الطبيعية في إصلاح الحمض النووي.
نُشرت الدراسة في المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية.
نمو غير طبيعي
يمكن أن تؤدي المتغيرات في جين MUTYH إلى تكوين نمو غير طبيعي في الجسم، وخاصة داخل القولون، مما يزيد من خطر الإصابة بسرطان القولون المميت.
وتعد هذه المتغيرات شائعة أيضًا إلى حد ما، حيث يحمل ما يصل إلى واحد من كل 50 شخصًا في الولايات المتحدة متغيرات خطرة في هذا الجين.
وقال كيتزمان، الأستاذ المشارك في علم الوراثة البشرية: "من المهم حقًا تحديد المجموعة الفرعية من الأفراد الذين لديهم عامل خطر عائلي موروث، لأن الوقاية قد تكون منقذة للحياة بالنسبة لهم".
ليست كل المتغيرات، أو الطفرات، متشابهة.
المتغيرات غير المنطقية هي تلك التي تكسر الجين في حين أن المتغيرات المرادفة ليس لها أي تأثير وهي حميدة.
تنشأ المتغيرات التي يطلق عليها اسم المتغيرات غير المتماثلة عندما يؤدي التغيير في تسلسل الحمض النووي إلى إنشاء بروتين مختلف.
ولفحص هذه المتغيرات، بدلاً من إنشاء نماذج خلوية أو حيوانية تعبر عن متغير واحد في كل مرة لدراسة أي تغييرات وظيفية، استخدم الفريق نموذجًا مجمعًا ينشئ كل متغير في MUTYH قدر الإمكان، مما أدى إلى إنشاء مكتبة طفرات تضم 10941 متغيرًا.
ثم استخدموا جهازًا لتقرير إصلاح الحمض النووي لقياس وظيفة كل متغير بشكل منهجي.
"في الأساس، نقوم بوضع جهاز استشعار للضرر التأكسدي في الخلايا والذي سوف يضيئها باللون الأخضر إذا كان هناك إصلاح مناسب ولا يضيء إذا تم كسر وظيفة الإصلاح"، كما أوضح كيتزمان.
ثم قاموا بتصنيفهم إلى فئتين: وظيفية وغير وظيفية.
وباستخدام هذه الطريقة، تمكنوا من فرز المتغيرات غير المنطقية بدقة من المتغيرات المترادفة أو الصامتة.
كما قاموا أيضًا بتحديد العديد من المتغيرات ذات المعنى الخاطئ التي تقع في النطاق المتوسط مع التأثيرات التي تقع على طول استمرارية الوظيفة.
وعلاوة على ذلك، أكد الباحثون الأهمية السريرية لهذه الطفرات في MUTYH من خلال مقارنتها بقاعدة بيانات ClinVar التابعة للمركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية، والتي تحتوي على المتغيرات التي تم العثور عليها أثناء الاختبارات الجينية والتي تمت مراجعتها وتصنيفها من قبل الأطباء.
وقال كيتزمان: "اتضح أن بعض الطفرات في جين MUTYH شوهدت في المجتمعات البشرية، وقد تم التقاط درجة مسبباتها للأمراض بشكل مثالي من خلال تحليلنا".
على سبيل المثال، يتوافق أحد المتغيرات التي تقع ضمن النطاق المتوسط مع متغير سريري معروف بظهور متأخر وشكل أخف من تطور السليلة.
ويقول كيتزمان إنه بالإضافة إلى تقديم المزيد من الأدلة حول ما تفعله المتغيرات ذات الأهمية غير المؤكدة في الواقع، يمكن استخدام هذا النوع من التحليل الوظيفي لمساعدة الناس على اتخاذ قرارات أكثر استنارة بشأن الوقاية من الأمراض من خلال معلوماتهم الجينية .
وأضاف: "أصبحت الاختبارات الجينية أكثر شيوعًا، وفي حين يمكننا قراءة الحروف في الكتاب، فإننا لا نعرف كيفية تحويلها إلى كلمات وجمل أو كيفية فهم معنى تلك الجمل".
وتابع: "نحن بحاجة إلى استمرار تمويل البحوث العلمية الأساسية لتحقيق الفوائد الحقيقية، مثل القدرة على تفسير مخاطر الإصابة بالسرطان من الاختبارات الجينية، والتي يمكن أن تساهم في الوقاية من الأمراض المنقذة للحياة".
