الخزعة السائلة.. طريقة مبتكرة لتشخيص السرطان بكفاءة أكبر

من المتوقع أن تُحدث تقنية جديدة للخزعة السائلة نقلة نوعية في تشخيص السرطان ومتابعته، بتجاوزها تحدي يتمثل في تحقيق حساسية عالية وتغطية واسعة وسير عمل بسيط في آن واحد.

وقد قام فريق من الباحثين من شركة جينوميل هيلث، وجامعة توركو، ومستشفى تي واي كيه إس توركو الجامعي في فنلندا، بمقارنة هذه الطريقة الجديدة، المسماة "بريدج كابتشر"، مع اثنتين من الأدوات الرائدة في السوق.

يسلط تحليلهم ، الذي نُشر في مجلة التشخيص الجزيئي، الضوء على بساطة الطريقة وفعاليتها من حيث التكلفة وقابليتها للتكرار وقابليتها للتوسع، مما يجعلها مناسبة تمامًا للاختبارات السريرية الروتينية ومراقبة الأمراض واختيار العلاج .

يشهد تشخيص السرطان تحولاً من الخزعات النسيجية إلى الخزعات السائلة. يتميز هذا النهج طفيف التوغل بالسرعة، ويمكنه توفير نظرة شاملة على التركيب الجيني للورم. مع ذلك، تواجه الخزعات السائلة الحالية تحديات رئيسية تتعلق بالأداء.

وقال مانو تامينين: "عادةً ما تغطي الاختبارات السريعة والحساسة عددًا محدودًا من المتغيرات التي تتطلب معلومات مسبقة من خزعة نسيجية، بينما تكشف طرق أخرى عن نطاق واسع من المتغيرات، إلا أنها تتطلب إجراءات معقدة، مما يؤدي إلى فترات انتظار طويلة، وتكاليف أعلى، ومخاطر أكبر للخطأ البشري، ونتيجة لذلك، غالبًا ما تحتاج العيادات إلى فحوصات مختلفة للكشف المبكر، أو اختيار العلاج، أو مراقبة المرض، مما يضعها أمام خيار صعب بين الحساسية والسرعة وعدد المتغيرات التي يمكنها فحصها".

لمعالجة هذا التحدي، طُوِّرت تقنية Bridge Capture، وهي طريقة تسلسل جيني مستهدفة من الجيل التالي. قيّمت هذه الدراسة تقنية Bridge Capture باستخدام عينات مصطنعة من سرطان القولون والمستقيم تحاكي الحمض النووي الورمي المتداول (ctDNA) عبر نطاق واسع من ترددات الأليلات المتغيرة.

تمت مقارنة أداء تقنية Bridge Capture مع اثنين من أبرز اختبارات الخزعة السائلة التجارية (Archer LIQUIDPlex و Illumina AmpliSeq CHPv2).

أظهرت Bridge Capture توافقًا قويًا مع كلا الاختبارين، مع قدرتها على الكشف عن أدنى تردد للأليل المتغير، مما يدل على حساسيتها الفائقة تجاه متغيرات الحمض النووي الخلوي الحر النادرة.

"تتوسع هذه التقنية من لوحات النقاط الساخنة المدمجة إلى محتوى أكبر بكثير دون تغيير سير العمل الأساسي. وهذا يعني أن طريقة واحدة يمكن أن تخدم كلاً من التحليلات السريرية المركزة اليوم واللوحات الأوسع نطاقاً غداً"، كما يشير الدكتور تامينين.

سهولة الاستخدام العملية

تم تقييم أداء برنامج Bridge Capture من حيث سهولة الاستخدام العملي. وقد حافظ البرنامج على نتائج متطابقة تقريبًا حتى عند تقليل عمق القراءة عشرة أضعاف، مما يدعم الاستخدام الفعال لعمق التسلسل.

يشير المؤلف المشارك الرئيسي، أنطوني كوركياكوسكي، إلى أنه "نظراً لأن تقنية Bridge Capture تستخدم قدرة التسلسل بكفاءة عالية، يمكنك الحصول على نتائج تردد الأليلات المتغيرة المنخفضة دون الحاجة إلى التسلسل العميق، وهذا يترجم مباشرة إلى انخفاض تكلفة العينة الواحدة، ويفتح المجال أمام الاختبارات عالية الحساسية للمختبرات ذات ميزانيات التسلسل المحدودة".

أظهرت الاختبارات بين المختبرات نتائج متسقة، وكانت النتائج قابلة للتكرار بين سير العمل اليدوي والآلي، مما يدل على موثوقية عالية وقابلية تطبيق واسعة. ومع تزايد انتقال اختبارات الكشف عن السرطان من المختبرات المركزية الكبيرة إلى مواقع أصغر لا مركزية، فإن سير عمل بسيط ومتعدد الاستخدامات يعمل بكفاءة على أجهزة ذات إنتاجية منخفضة إلى متوسطة يُمكّن من إجراء اختبارات الخزعة السائلة بتكلفة معقولة بالقرب من المريض.

وقال مخترع هذه التقنية، الدكتور يوها-بيكا بورسيهيمو: "صُممت تقنية Bridge Capture لتناسب واقع التسلسل السريري اليوم: فالمختبرات تحتاج إلى حساسية عالية للكشف عن المتغيرات النادرة، ولكنها تحتاج أيضاً إلى إجراءات عمل بسيطة وسريعة وفعّالة من حيث التكلفة، تُظهر نتائجنا أنه لم يعد من الضروري التضحية بأحدهما على حساب الآخر".

وتضيف سيمونا أداموسوفا، المؤلفة الرئيسية المشاركة: "لم يكن المهم بالنسبة لنا مجرد الأداء الذي حققناه بأنفسنا، بل ما إذا كان بإمكان مختبر آخر إجراء التجربة بنفس السهولة والحصول على نتيجة مماثلة. وتؤكد بيانات قابلية التكرار صحة هذا الأمر".

ويختتم الدكتور تامينين قائلاً: "لقد أُعجبنا بشكل خاص بأداء تقنية Bridge Capture مقارنةً بالتقنيات التجارية الراسخة، ولا سيما قدرتها على الكشف عن ترددات الأليلات المتغيرة المنخفضة للغاية، ومع إمكانية توسيع نطاق هذه الطريقة لتشمل مجموعات أكبر مع الحفاظ على سير عمل بسيط، فإننا نرى إمكانات قوية لتطبيقات أوسع، بما في ذلك الكشف المبكر عن السرطان".